本ゲームでは、タイトルメニューやメニューの「コンフィグ」内「操作設定」で、ボタンに割り当てる操作を変更することができます。このオンラインマニュアルでは、初期設定の操作割り当てで説明します。
このゲームはタッチ操作には対応していません。
フィールドの操作
| Lスティック、方向ボタン | 移動 |
|---|---|
| Aボタン | アクション（話す、調べるなど） |
| Bボタン | （移動中押し続けて）ダッシュ |
| Xボタン | クイックセーブ |
| Yボタン | メニューの表示 |
| ＋ボタン | ポーズ |
| −ボタン | DIG！DIG！ディガーの表示 |
| Rスティック | （押す）倍速ON/OFF |
バトル中の操作
| Lスティック、方向ボタン | （左右）武器切り替え、（上下）コマンドの選択 |
|---|---|
| Aボタン、Lボタン | 決定 |
| Bボタン | キャンセル |
| Xボタン | 状態表示ON/OFF |
| Yボタン | ステータスの表示 |
| Rボタン | 「身を守る」のショートカット |
| ＋ボタン | ポーズ |
| Rスティック | （押す）倍速ON/OFF |
その他の操作
以下はメニュー画面などの基本的な操作です。各画面固有の操作については、画面下部などの操作ヘルプを参考にしてください。
| Lスティック、方向ボタン | カーソルの移動 |
|---|---|
| Aボタン | 決定 |
| Bボタン | キャンセル |
| Yボタン | （会話中）メッセージログの表示 |
| Lボタン／Rボタン | ページ切り替え |
| ZLボタン／ZRボタン | ページ送り |
| ＋ボタン | ヒントの表示 |
Lボタン、Rボタン、＋ボタンを同時に押すと、ソフトリセットしてタイトル画面にもどります。
以降のページでは、Aボタンを「決定ボタン」、Bボタンを「キャンセルボタン」と表記して説明します。