「ベイロンシティ」――どこの国にも属さない、太平洋に浮かぶメガフロート型の都市。
新エネルギー資源「オルゴニウム」を採掘し、世界でもっとも注目されるこの都市では、「Ｄ災害」と呼ばれる、「悪魔」の引き起こす特殊な事件が多発していた。

シュウとキサラの活躍により解決した「ある大事件」以降、ベイロンシティでは新興ＰＭＣ（民間軍事会社）が続々と参入していた。
そんな中、主人公も自身の目的を果たすために「ライジングサン・ミリタリーカンパニー」を設立する。

会社は立ち上がったばかりで悪魔に太刀打ちする戦力もこれからという時、主人公の元に特殊な力を持った少女・クロエが現れた。
ＰＭＣに所属したことのないクロエだったが、クロエの「体験主義」に主人公は共感する。
その後も、元軍人である葵、裏社会とパイプを持つエミリオ、メカの天才ノエルと続々と心強いメンバーが揃った。
皆、それぞれの目標を持ち、主人公の目的に共感した仲間たちだ。

主人公の目的とは、一つでも多くの悲劇を止める事と、……自身が患った悪魔の呪いを解決する事……。

主人公の呪い、クロエの目的、ベイロンシティで引き続き発生する幾多の悪魔災害。
巧みなチームワークでD災害を解決しつつ、主人公たちは少しずつ目的に近づいていく。
ライジングサンが目指す夜明けの先にあるものは――。